初步處理
首先，將收集到的污水導入格柵池，格柵池通過網格過濾，對大塊的雜物如石頭、樹葉、紙張、布料進行篩選，并將這些雜物在格柵上沉積。再通過一系列的噴淋系統，接著將水送入沉淀池中，混合物在沉淀池中，重力作用下將污泥沉積在池底。對于浮在水面上的不溶性雜質，則通過除油器進行處理。之后，經過一段時間的處理，沉積下來的污泥被抽出并送入污泥處理系統。
生化處理
生化處理是松陽污水處理的關鍵步驟。在生化處理系統中，利用生物來降解污水中的有機物，從而凈化水質。生化處理采用“曝氣法”，系統內的污水通過人工加氧的方式，可以使生物呼吸代謝加速，并且為其生長繁殖提供了良好的生長環境。水處理過程中的氣泡由底部的曝氣裝置拉起，擾動了水的表面，促進氧氣向水中擴散，同時也起到了攪拌水體的作用。經過這一步驟，生化處理系統能有效地去除松陽污水中的氨氮、有機物、磷酸鹽等成分。
后處理
為了確保出水水質符合相關標準，松陽污水處理廠還需要進行二次沉淀、濾過、消毒、氧化等后處理，然后將水體排放向大海。二次沉淀能夠將曝氣池中未完全降解的有機物、微生物和固體雜質從水中除去，濾過過程則利用石英砂等物質對水進行過濾，排除水中的雜質，接著加入消毒劑進行消毒和消毒劑殘留的深度催化氧化反應。最終得到的出水符合國家的各項排放標準，達到不錯的凈化效果。
